iPhone SE รุ่นแรก มีดีไซน์เหมือนกับ iPhone 5s ขณะที่ iPhone SE รุ่นที่ 2 เลือกใช้ดีไซน์คล้ายกับ iPhone 8 แต่ดีไซน์เนอร์ของ Apple Lab เชื่อว่า iPhone SE รุ่นที่ 3 จะได้รับการออกแบบมาให้แตกต่างไปจากกรอบเดิมๆ ของ Apple
ผู้ใช้ Twitter @aaple_lab สร้างคอนเซ็ปต์ iPhone SE รุ่นใหม่ ที่มาในสีสันสดใส มีให้เลือกหลายสี รวมถึงสีม่วงที่นำมาใช้กับ iPhone 12 โดดเด่นที่จอแสดงผลแบบ Hole-Punch Display เจาะหลุมไว้ตรงกึ่งกลางเพื่อวางกล้องหน้า และมีพื้นที่ขอบจอบางเฉียบทั้ง 4 ด้าน จึงไม่มีปุ่มโฮมใต้หน้าจออีกต่อไปแล้ว
คอนเซ็ปต์ iPhone SE รุ่นใหม่ จาก Apple Lab ไม่มีเซ็นเซอร์สแกนลายนิ้วมือที่ด้านหลัง จึงเป็นไปได้ที่จะย้าย Touch ID ไปรวมกับปุ่มเพาเวอร์แบบ iPad Air รุ่นที่ 4 ที่เปิดตัวในปี 2020
ถึงแม้ ภาพเรนเดอร์ข้างต้น จะเป็นเพียงคอนเซ็ปต์ แต่รายงานก่อนหน้านี้จาก Ross Young ผู้ก่อตั้ง Display Supply Chain Consultants และ DisplaySearch ก็เคยอ้างว่า iPhone SE ในอนาคต อาจถูกเจาะหลุมบนหน้าจอเพื่อติดตั้งกล้องหน้า แต่ต้องรอไปถึงปี 2023